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GENÉTICA HUMANA
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DOCTORADO                Cursos 2006/2007

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Publicaciones (2000-2007)

 
         Sanchez-Magraner L, Viguera AR, Garcia-Pacios M, Garcillan MP, Arrondo JL, de la Cruz F, Goni FM, Ostolaza H (2007). "The calcium-binding C-terminal domain of Escherichia coli alpha -haemolysin is a major determinant in the surface-active properties of the protein." J Biol Chem. Feb 26; [Epub ahead of print]. Solicitar pdf.
 
         Garcillán-Barcia MP, Jurado P, González-Pérez B, Moncalián G, Fernández LA, de la Cruz F (2007). "Conjugative transfer can be inhibited by blocking relaxase activity within recipient cells with intrabodies". Mol Microbiol 63(2):404-16. Solicitar pdf.
 
          Moncalián G, Cardenes N, Deribe YL, Spinola-Amilibia M, Dikic I, Bravo J (2006). "Atypical polyproline recognition by the CMS N-terminal Src homology 3 domain." J Biol Chem. 281(50):38845-53. Archivo pdf.
 

        César CE, Machón C, de la Cruz F, Llosa M (2006). "A new domain of conjugative relaxase TrwC responsible for efficient oriT-specific recombination on minimal target sequences". Mol Microbiol 62(4):984-996. Archivo pdf.

 

          Fernández-López R, Garcillán-Barcia MP, Revilla C, Lázaro M, Vielva L, de la Cruz F (2006). "Dynamics of the IncW genetic backbone imply general trends in conjugative plasmid evolution". FEMS Microbiol Rev 30(6):942-966. Archivo pdf.

 
          Yim G, de la Cruz F, Spiegelman GB, Davies J (2006). "Transcription modulation of S. typhimurium promoters by sub-MIC levels of rifampicin". J Bacteriol 188(22):7988-7991. Archivo pdf.
 
          Perez-Mendoza D, Lucas M, Munoz S, Herrera-Cervera JA, Olivares J, de la Cruz F, Sanjuan J (2006). "The relaxase of the Rhizobium etli symbiotic plasmid shows nic site cis-acting preference". J Bacteriol 188(21):7488-7499. Archivo pdf.
 
           Hormaeche I, Segura RL, Vecino AJ, Goni FM, de la Cruz F, Alkorta I (2006). "The transmembrane domain provides nucleotide binding specificity to the bacterial conjugation protein TrwB". FEBS Lett 580(13):3075-82. Archivo pdf.
 
            Boer R, Russi S, Guasch A, Lucas M, Blanco AG, Pérez-Luque R, Coll M, de la Cruz F (2006). "Unveiling the Molecular Mechanism of a Conjugative Relaxase: The Structure of TrwC Complexed with a 27-mer DNA Comprising the Recognition Hairpin and the Cleavage Site". J Mol Biol 358(3):857-869. Archivo pdf.
 

            Cabezón E, de la Cruz F (2006). "TrwB: An F1-ATPase-like molecular motor involved in DNA transport during bacterial conjugation". Res Microbiol 157:299–305. Archivo pdf.

 
            Jozic D, Cardenes N, Deribe YL, Moncalián G, Hoeller D, Groemping Y, Dikic I, Rittinger K, Bravo J (2005). "Cbl promotes clustering of endocytic adaptor proteins". Nat Struct Mol Biol. 12:972 - 979. Archivo pdf.
 

            de la Cruz F, Davies J (2005).“Industrial revolution and microbial evolution”. En: “The influence of cooperative bacteria on animal host biology” (Eds. M.J. McFall-Ngai, B. Henderson, E.G. Ruby), pp. 73-82. Advances in Molecular and Cellular Microbiology, vol. 10., Cambridge University Press, Cambridge USA. Archivo pdf.

 
            Draper O, César CE, Machón C, de la Cruz F, Llosa M (2005). "Site-specific recombinase and integrase activities of a conjugative relaxase in the recipient cell". Proc Natl Acad Sci USA 102:16385-16390. Archivo pdf.
 
            de Paz HD, Sangari FJ, Bolland S, García-Lobo JM, Dehio C, de la Cruz F, Llosa M (2005) "Functional interactions between Type IV secretion systems involved in DNA transfer and virulence". Microbiology 151:3505-3516. Archivo pdf.
 
            Fernández-López R, Machón C, Longshaw CM, Martin S, Molin S, Zechner EL, Espinosa M, Lanka E, de la Cruz F (2005) "Unsaturated fatty acids are inhibitors of bacterial conjugation". Microbiology 151:3517-3526. Archivo pdf.
 
            Pérez-Mendoza D, Sepúlveda E, Pando V, Muñoz S, Nogales J, Olivares J, Soto MJ, Herrera-Cervera JA, Romero D, Brom S, Sanjuan J (2005) "Identification of the rctA Gene, Which Is Required for Repression of Conjugative Transfer of Rhizobial Symbiotic Megaplasmids". J Bacteriol.187:7341-7350. Archivo pdf.
 
            Camacho EM, Serna A, Madrid C, Marqués S, Fernández R, de la Cruz F, Juárez A, Casadesús J (2005) "Regulation of finP transcription by DNA adenine methylation in the virulence plasmid of Salmonella enterica". J Bacteriol.187:5691-5699. Archivo pdf
 

            Schamel W W A, Aréchaga I, Risueño RM, van Santen HM, Cabezas P, Risco C, Valpuesta JM, Alarcón B (2005) "Coexistence of multivalent and monovalent TCRs explains high sensitivity and wide range of response". J Exp Med. 202:493–503. Archivo pdf.

 
            Tato I, Zunzunegui S, de la Cruz F, Cabezón E (2005) "TrwB, the coupling protein involved in DNA transport during bacterial conjugation, is a DNA-dependent ATPase". Proc Natl Acad Sci USA 102:8156-61. Archivo pdf.
 
            Llosa M, de la Cruz F (2005) "Bacterial conjugation: a potential tool for genomic engineering". Res Microbiol. 156:1-6. Archivo pdf
 
            Moncalián G, de la Cruz F (2004) " DNA binding properties of protein TrwA, a possible structural variant of the Arc repressor superfamily". Biochim Biophys Acta 1701:15-23. Archivo pdf
 
            Pérez-Mendoza D, Domínguez-Ferreras A, Muñoz S, Soto MJ, Olivares J, Brom S, Girard L, Herrera-Cervera JA, Sanjuan J (2004) "Identification of functional mob regions in Rhizobium etli: evidence for self-transmissibility of the symbiotic plasmid pRetCFN42d." J Bacteriol. 186:5753-61. Archivo pdf
 
           Gomis-Ruth FX, Sola M, de la Cruz F, Coll M. (2004) "Coupling factors in macromolecular type-IV secretion machineries." Curr Pharm Des.10:1551-65. Archivo pdf
 
            Francia MV, Varsaki A, Garcillan-Barcia MP, Latorre A, Drainas C, de la Cruz F. (2004). "A classification scheme for mobilization regions of bacterial plasmids." FEMS Microbiol Rev. 28(1):79-100. Archivo pdf.
 
            Hormaeche I, Iloro I, Arrondo JL, Goni FM, de la Cruz F, Alkorta I. (2004). "Role of the transmembrane domain in the stability of TrwB, an integral protein involved in bacterial conjugation." J Biol Chem. 279(12):10955-61. Archivo pdf.
 
            Moncalián G, Lengsfeld B, Bhaskara V, Hopfner KP, Karcher A, Alden E, Tainer JA, Paull TT (2004). "The rad50 signature motif: essential to ATP binding and biological function". J Mol Biol. 335:937-51. Archivo pdf.
 

Guasch A, Lucas M, Moncalian G, Cabezas M, Perez-Luque R, Gomis-Ruth FX, de la Cruz F, Coll M. (2003) "Recognition and processing of the origin of transfer DNA by conjugative relaxase TrwC." Nat Struct Biol. 10(12):1002-10. Archivo pdf

 

Seubert A, Hiestand R, de la Cruz F, Dehio C. (2003) "A bacterial conjugation machinery recruited for pathogenesis." Mol Microbiol. 49(5):1253-66. Archivo pdf

 
            Llosa M, Zunzunegui S, de la Cruz F. (2003) "Conjugative coupling proteins interact with cognate and heterologous VirB10-like proteins while exhibiting specificity for cognate relaxosomes." Proc Natl Acad Sci U S A. 100(18):10465-70. Archivo pdf
 

Cabezón E, Montgomery MG, Leslie AG, Walker JE. (2003) "The structure of bovine F1-ATPase in complex with its regulatory protein IF1." Nat Struct Biol. 10(9):744-50. Archivo pdf

 
            Aréchaga, I., Miroux, B., Runswick, M. J. & Walker, J. E. (2003). "Over-expression of Escherichia coli F1F(o)-ATPase subunit a is inhibited by instability of the uncB gene transcript". FEBS Lett 547, 97-100. Archivo pdf
 
            Jekabsons, M. B., Echtay, K. S., Arechaga, I. & Brand, M. D. (2003). "Molecular properties of purified human uncoupling protein 2 refolded from bacterial inclusion bodies". J Bioenerg Biomembr 35, 409-18. Archivo pdf

 

            Murata, T*., Arechaga, I*., Fearnley, I. M., Kakinuma, Y., Yamato, I. & Walker, J. E. (2003). (*equal contributors) "The membrane domain of the Na+-motive V-ATPase from Enterococcus hirae contains a heptameric rotor".  J Biol Chem 278, 21162-7. Archivo pdf

 
            Varsaki A, Lucas M, Afendra AS, Drainas C, de la Cruz F. (2003) "Genetic and biochemical characterization of MbeA, the relaxase involved in plasmid ColE1 conjugative mobilization." Mol Microbiol. 48(2):481-93. Archivo pdf
 

Arrondo JL, Echabe I, Iloro I, Hernando MA, de la Cruz F, Goñi FM. (2003). "A bacterial TrwC relaxase domain contains a thermally stable alpha-helical core." J Bacteriol. 185(14):4226-32. Archivo pdf.

 
             Martinez LO, Jacquet S, Esteve JP, Rolland C, Cabezon E, Champagne E, Pineau T, Georgeaud V, Walker JE, Terce F, Collet X, Perret B, Barbaras R. (2003) "Ectopic beta-chain of ATP synthase is an apolipoprotein A-I receptor in hepatic HDL endocytosis." Nature 421:75-9. Archivo pdf
 
            Hormaeche, I., Alkorta, I., Moro, F., Valpuesta J.M., Goñi, F.M. and de la Cruz, F. (2002) “Purification and properties of TrwB, a hexameric, ATP-binding integral membrane protein essential for R388 plasmid conjugation” J Biol Chem. 277:46456-46462. Archivo pdf
 
            Gomis-Ruth FX, de la Cruz F, Coll M. (2002)  "Structure and role of coupling proteins in conjugal DNA transfer." Res Microbiol. 153(4):199-204. Archivo pdf
 
            Llosa M., F.X. Gomis-Rüth, M. Coll y F. de la Cruz  (2002) “Bacterial conjugation: a two-step mechanism for DNA transport” Mol Microbiol.  153:199-204. Archivo pdf
 
            Cabezón, E., Butler, P.J., Runswick, M.J., Carbajo, R.J., and Walker, J.E. (2002) "Homologous and heterologous inhibitory effects of ATPase inhibitor proteins on F-ATPases." J Biol Chem. 277: 41334-41341. Archivo pdf
 
           Gomis-Rüth F.X., G. Moncalián, F. de la Cruz y M. Coll  (2002) “Conjugative plasmid protein TrwB, an integral membrane type IV secretion system coupling protein: detailed structural features and mapping of the active site cleft” J Biol Chem. 277:7556-7566. Archivo pdf
 
           Hopfner KP, Craig L, Moncalián G, Zinkel RA, Usui T, Owen BA, Karcher A, Henderson B, Bodmer JL, McMurray CT, Carney JP, Petrini JH, Tainer JA. (2002) "The Rad50 zinc-hook is a structure joining Mre11 complexes in DNA recombination and repair". Nature 418:562-6. Archivo pdf
 
           Machón C., S. Rivas, A. Albert,  F.M. Goñi y F. de la Cruz  (2002) “TrwD, the hexameric traffic ATPase encoded by plasmid R388 induces membrane destabilization and hemifusion of lipid vesicles.” J Bacteriol. 184:1661-1668. Archivo pdf
 
           de la Cruz F., J.M. García-Lobo y J. Davies (2002) “Antibiotic resistance: on how bacterial populations respond to a simple evolutionary force”  en “Bacterial Resistance to Antimicrobials:  Mechanisms, Genetics, Medical Practice and Public Health” pp. 19-36 (K. Lewis, A. Salyers, H. Taber, y R. Wax, editores)  Editorial Marcel Dekker
 
            Arechaga, I., Butler, P. J. & Walker, J. E. (2002). "Self-assembly of ATP synthase subunit c rings". FEBS Lett 515, 189-93. Archivo pdf
 
             Ledesma, A., de Lacoba, M. G., Arechaga, I. & Rial, E. (2002). "Modeling the transmembrane arrangement of the uncoupling protein UCP1 and topological considerations of the nucleotide-binding site".  J Bioenerg Biomembr 34, 473-86. Archivo pdf
 
             Arechaga, I., Ledesma, A. & Rial, E. (2001). "The mitochondrial uncoupling protein UCP1: a gated pore". IUBMB Life 52, 165-73. Archivo pdf
 
             Arechaga, I. & Jones, P. C. (2001). "The rotor in the membrane of the ATP synthase and relatives". FEBS Lett 494, 1-5. Archivo pdf
 
             Arechaga, I. & Jones, P. C. (2001). "Quick guide: ATP synthase". Curr Biol 11, R117. Archivo pdf
 
            Garcillán-Barcia M.P., I. Bernales, M.V. Mendiola, F. de la Cruz (2001)  “IS91 rolling-circle transposition”  en “Mobile DNA II” (N.L. Craig, R. Craigie, M. Gellert, A. Lambowitz, eds.) ASM Press, Washington.
 
            Cabezón, E., Runswick, M.J., Leslie, A.G., and Walker, J.E. (2001) "The structure of bovine IF(1), the regulatory subunit of mitochondrial F-ATPase". EMBO J. 20: 6990-6996. Archivo pdf
 
            Núñez B., F. de la Cruz (2001) “Two atypical mobilization proteins are involved in plasmid CloDF13 relaxation” Mol Microbiol. 39:1088-1099. Archivo pdf
 
            Gomis-Ruth F.X., G. Moncalián, R. Pérez Luque, A. González, E. Cabezón, F. de la Cruz, M. Coll (2001) “The bacterial conjugation protein TrwB resembles ring helicases and F1-ATPase” Nature 409:637-641. Archivo pdf
 
            Garcillán-Barcia M.P., I. Bernales, M.V. Mendiola, F. de la Cruz (2001) “Single-stranded DNA intermediates in IS91 rolling-circle transposition”  Mol Microbiol. 39:494-502. Archivo pdf
 
            Krause  S., W. Pansegrau, R. Lurz, F. de la Cruz, E. Lanka (2000) “Enzymology of Type IV Macromolecule Secretion Systems: The Conjugative Transfer Regions of Plasmids RP4 and R388 and the cag Pathogenicity Island of Helicobacter pylori Encode Structurally and Functionally Related Nucleoside Triphosphate Hydrolases” J Bacteriol. 182:2761-2770. Archivo pdf
 
            de la Cruz F., J. Davies (2000)  “Horizontal gene transfer and the origin of species: lessons from bacteria” Trends Microbiol. 8:128-133. Archivo pdf
 
            Cabezón, E., Butler, P.J., Runswick, M.J., and Walker, J.E. (2000) "Modulation of the oligomerization state of the bovine F1-ATPase inhibitor protein, IF1, by pH."  J Biol Chem. 275: 25460-25464. Archivo pdf
 
            Cabezón, E., Arechaga, I., Jonathan, P., Butler, G., and Walker, J.E. (2000). "Dimerization of bovine F1-ATPase by binding the inhibitor protein, IF1" J Biol Chem. 275: 28353-28355. Archivo pdf
 
            Grandoso  G., P. Avila, A. Cayón, M.A. Hernando, M. Llosa, F. de la Cruz (2000) “Two active-site tyrosyl residues of protein TrwC act sequentially at the origin of transfer during plasmid R388 conjugation”  J Mol Biol. 295:1163-1172. Archivo pdf
 
            Zechner, E. L., de la Cruz, F., Eisenbrandt, R., Grahn, A. M., Koraimann, G., Lanka, E., Muth, G., Pansegrau, W., Thomas, C. M., Wilkins, B. M., Zatyka, M. (2000).  “Conjugative-DNA transfer processes”  En "The Horizontal Gene Pool:  Bacterial Plasmids and Gene Spread" (Thomas, C. M., ed.), pp. 87-173. Harwood Academic Publishers, London.
 
            Arechaga, I., Miroux, B., Karrasch, S., Huijbregts, R., de Kruijff, B., Runswick, M. J. & Walker, J. E. (2000). "Characterisation of new intracellular membranes in Escherichia coli accompanying large scale over-production of the b subunit of F(1)F(o) ATP synthase". FEBS Lett 482, 215-9. Archivo pdf
 
             Stock, D., Gibbons, C., Arechaga, I., Leslie, A. G. & Walker, J. E. (2000). "The rotary mechanism of ATP synthase". Curr Opin Struct Biol 10, 672-9. Archivo pdf
 
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