En el Santander renacentista tuvo especial relevancia la familia Riva-Herrera, este linaje procede de Gajano, donde aún se conserva su torre. Eran quienes controlaban el puerto. Don Fernando de Riva-Herrera fue capitán de las flotas que partían de Santander, cargadas de lana para Flandes. Ocupaba el cargo de Proveedor General de las Armadas del Océano. Tenían una casa-fuerte en Pronillo, que a mediados del XVI se transforma en palacio. A esta familia se debe también la capilla del mismo nombre, situada en la Catedral, en la nave del Evangelio.

De este momento son el desaparecido Convento de San Francisco y el Convento de Santa Cruz (actual Tabacalera). En 1835 se expulsó a la comunidad de Clarisas Descalzas y está ocupado por la Fábrica de Tabacalera desde 1838.

Al periodo barroco pertenecen la iglesia de Consolación y el Hospital de San Rafael (actual sede de la Asamblea Regional) fundado a finales del XVIII. En el edificio aparecen ya preocupaciones derivadas de las teorías higienistas de la ilustración, como la buena ventilación, el alejamiento del centro de la ciudad...

Antes de adentrarnos en el siglo XIX, es necesario hablar del Ensanche de Santander. La reapertura del Camino de Reinosa, con el consiguiente aumento del tráfico portuario que esto conlleva, hace necesario ampliar el puerto y acondicionarlo a la nueva situación. Esto cambiará la ciudad. La mejora y ampliación del muelle y una serie de rellenos abre el espacio para una nueva población urbanizada con criterios lineales.